জাতীয় নাগরিক পার্টির (এনসিপি) আহ্বায়ক নাহিদ ইসলাম অভিযোগ করেছেন যে, গঙ্গা চুক্তি কার্যকর হওয়া থেকে বিরত রাখতে বাংলাদেশে বিভিন্ন উপায়ে বিশৃঙ্খলা সৃষ্টির পাঁয়তারা চালাচ্ছে ভারত।ডেইলি বাংলাদেশের তথ্য অনুযায়ী, সম্প্রতি এক বক্তব্যে তিনি এই মন্তব্য করেন। তিনি উল্লেখ করেন, এই চুক্তির বাস্তবায়ন প্রতিহত করতেই দেশের ভেতর অস্থিতিশীল পরিবেশ তৈরি করার অপচেষ্টা চলছে।